Microinvest Склад Pro използва изцяло нова архитектура на базата от данни. Идеологията е аналогична на големите ERP системи, реализацията е профилирана за Българския пазар и може адаптивно да се наглася за всеки бизнес модел. Цялата идеология позволява наследственост на документите и трансформация на операциите. Примерен бизнес – цикъл е:
Поръчка от клиент – Заявка към доставчик – Доставка на стоката – Оферта към клиента – Проформа фактура – Продажба – Плащане.
Последователноста на бизнес-цикъла се генерира автоматично, според желанието на клиента. Данните се трансформират без да е необходимо допълнително въвеждане.

Ключовите точки на новата архитектура са:
    Номенклатурите са йерархични, всичко може да се структурира дървовидно и аналогично на файловете в Windows. Няма ограничения за нивата на вложеност. Потребителят сам може да си структурира данните и да активира към тях принадлежност към една или друга група. Това позволява да се въвеждат каталожни номера, групи от стоки, различни обекти, разпределени по градове и много други.
    Всички операции са документно независими, т.е. няма ограничение на броя на операциите и вида на операциите, както и обема на съхраняваните данни. В програмата има показалец, който определя вида на операцията и дали тя е приходна или разходна. Пример за това е доставка, с идентификатор +1, т.е. операцията заприхождава стока. Аналогично операция Продажба е с –1, разходна операция. Трансферът от обект в обект се състои от последователно –1 от първият склад и +1 във втория. Офертата е с коефициент 0. В системата могат да се зададат безкрайно много различни операции, като Гаранционна Карта, Експертен лист и Отложени доставки.
Последователния запис на операциите позволява редакция на всички данни, по всяко време! Анулирате определена операция или променяте количество – програмата прекалкулира данните и установява правилните количества в склада. Независимите документи могат да мигрират един в друг.
    Свойства на стоките. Чрез неструктурирана база от данни и подходящ алгоритъм всяка стока ще има собствени свойства. Това позволява дефиниране на допълнения към стоката – местоположение в склада, срок на годност, сериен номер, цвят и размер, снимка, принадлежност и неограничено количество допълнителни характеристики.
    Надграждане: Архитектурата позволява бъдещо развитие на продукта в посока на цялостно управление на процесите и обхващане на цикъла на работа на предприятието. Това ще доведе до пълна система за управление на всички звена от организацията с необходимите елементи на счетоводната отчетност и съответните справки.